En este doctorado la tutoría se lleva a cabo por medio de un proceso de acompañamiento académico. Desde que los estudiantes son aceptados en este doctorado pueden contar con un equipo de hasta cinco doctores. Los estudiantes tienen de forma obligatoria un director de tesis, el cual puede ser acompañado por un codirector y un asesor. Al ser aceptados los estudiantes, el director propone a la Junta Académica un comité de seguimiento tutoral integrado por al menos dos investigadores con grado de doctor, la Junta Académica revisa que los perfiles sean adecuados para el proyecto del estudiante y valida o modifica la propuesta.
El trabajo de seguimiento tutoral consiste en dar asesoría al estudiante en el campo de conocimiento de los tutores. Además, al final de cada semestre los estudiantes presentan un trabajo denominado “Seminario de avances de investigación” el cual tiene créditos asignados. En este seminario los estudiantes presentan a su comité tutoral sus avances de investigación durante el semestre que termina y los integrantes del comité escuchan, cuestionan y sugieren modificaciones y mejoras al proyecto de tesis. Todas las observaciones y calificaciones de estos seminarios se registran en actas. Al terminar todos los seminarios de investigación se promedia la calificación y se solicita a Control Escolar que se asienten los créditos en el kardex del estudiante.